乳腺囊肿可以通过药物治疗或手术治疗消除，平时还需注意饮食和生活方式干预，预防复发，但相当一部分乳腺囊肿都不需要治疗。
1、药物治疗
可以在乳腺囊肿的囊腔内注射曲安奈德等糖皮质激素进行治疗，对部分乳腺囊肿有效，但是复发率比较高，部分乳腺囊肿没有明显作用，所以临床上一般很少采用。
2、手术治疗
包括乳腺囊肿穿刺抽液治疗、乳腺囊肿切除手术治疗。
（1）乳腺囊肿穿刺抽液治疗
适合于体积比较小的乳腺囊肿，需要在超声引导下进行。囊液抽干净后，需要使用无菌辅料包盖穿刺的针孔处，并且进行加压包扎，预防渗出。治疗效果比较好，但是有一定的复发几率。抽出的囊液需要进行实验室检查，明确囊肿的病理性质。
（2）乳腺囊肿切除手术治疗
需要先明确囊肿所在的具体位置和大小，然后在乳腺边缘部位做一弧形切口，切口的长度与肿物的大小相当，分离各层组织，显露乳腺囊肿，将乳腺囊肿分离并摘除，充分止血后依次缝合各层组织，关闭手术切口，切除的肿物同样做病理活检。做乳腺囊肿摘除手术治疗，可以达到治愈的效果，一般不会复发。
3、生活和饮食干预
尽量不要服用含雌激素的药物，避免进食含有雌激素的营养素补充剂以及有可能含雌激素的特殊食物。平时注意保持心态平和，心情愉悦，避免抑郁、焦虑、暴躁等负面情绪的影响，尽量不要穿过紧、过窄的内衣。
另外，没有临床症状，而且体积较小的乳腺囊肿，一般无需医学治疗。
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